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健康人膀胱中的尿是无菌的——没有细菌或其他感染微生物存在。尿道负责将膀胱内的尿液输送到体外，其中没有细菌或细菌含量极低不至于引起感染。但是，尿路的任何部位都可受到感染。尿路任何部位的感染都称为尿路感染 (UTI)。
引起感染的病原微生物通常经两个途径侵入尿路。最常见的途径为经下尿路末端——男性尿道在阴茎的开口或女性尿道在外阴的开口。感染延尿道向上扩散至膀胱，有时会累及一侧或双侧肾脏。另一可能的途径是经血液直接感染肾脏。
尿路感染 (UTI) 绝大多数由细菌引起，但一些病毒、真菌和寄生虫也可引起尿路感染。根据《默沙东诊疗手册》的表述，85% 以上的尿路感染由来自肠道或阴道的细菌引起。然而，一般情况下，进入尿路的细菌在膀胱排空时被尿液冲刷出体外。
细菌
下尿路细菌感染（通常是膀胱感染）十分常见，尤其见于年轻、性活跃的女性。年轻女性还经常出现细菌性肾脏感染，不过没有膀胱感染频繁。大肠杆菌是导致尿路感染的最常见细菌。20-50 岁的人中，尿路感染在女性的发病率约为男性的 50 倍。男性的尿道较长，细菌难以逆行较长距离而引起感染。在约 20 到 50 岁的男性中，最常见的尿路感染是尿道炎或前列腺炎。在50岁以上的人，UTIs在男性和女性均较常见，性别差异不大。
病毒
单纯疱疹病毒可引起尿道感染，患者出现尿痛和膀胱排空困难。除非患者的免疫系统受到损害（例如因为癌症、HIV/AIDS 或使用抑制免疫系统的药物而导致），否则其他病毒性尿路感染（如膀胱和肾脏感染）一般不会发生。
真菌
某些真菌或酵母菌可引起尿路感染。此类感染常称为酵母菌感染（酵母菌也可引起阴道发炎[阴道炎]）。真菌念珠菌是最常引起尿路酵母菌感染（念珠菌病）的微生物。念珠菌感染好发于免疫功能低下或膀胱留置尿管的患者。真菌和细菌可同时感染肾脏。
寄生虫
包括蠕虫在内的一些寄生虫可引起尿路感染。
滴虫病，由一种微小的寄生虫感染引起，是一种性传播疾病，可导致女性阴道中产生大量黄绿色泡沫样白带。偶然可引起膀胱或尿道感染。滴虫病可导致男性尿道感染。在男性中，其通常无症状。
血吸虫病，由一种称为吸虫的蠕虫感染所致，可累及肾脏、输尿管和膀胱。它是非洲、南美洲和亚洲严重肾衰竭患者的最常见原因。持续性膀胱血吸虫病可引起血尿或输尿管阻塞，最终可导致膀胱癌。
丝虫病是一种线虫感染，可阻塞淋巴管，使淋巴液进入尿液（乳糜尿）。本病可引起组织极度肿胀（象皮肿），在男性可波及阴囊。 |
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